Doktorand i medicinsk vetenskap - patogengenetik

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 38 000 studenter och 6 000 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Titel på projektet: Genomiska signaturer i patogener

Arbetsuppgifter
Allmänt om utbildning på forskarnivå: Utbildning i medicinsk vetenskap motsvarar studier om sammanlagt 240 högskolepoäng. Utbildningen bedrivs på heltid och ska leda till doktorsexamen. Utbildningen består i att genomföra ett vetenskapligt projekt och att delta i kurser på forskarnivå om minst 30 högskolepoäng. Utbildningen avslutas med att doktoranden skriver en vetenskaplig sammanläggningsavhandling eller en monografi motsvarande minst 120 högskolepoäng. För mer information om utbildning på forskarnivå vid Sahlgrenska akademin se https://medarbetarportalen.gu.se/sahlgrenskaakademin/forskarutbildning/

Projekt: Forskargruppen har nyligen funnit att den stora majoriteten av patogener (t.ex. virus och bakterier) har mycket specialiserad och optimerad arvsmassa, d.v.s. genom. Denna optimering är ytters artspecifik och kallas för genomisk signatur. Dessa genomiska signaturer ligger gömda i patogenernas DNA eller RNA och kan ses som ett slags art-specifikt fingeravtryck. Hur denna signatur ser ut beror på artspecifika egenskaper när det gäller att läsa, underhålla och replikera DNA och RNA. Det kan till exempel skilja sig mellan olika patogener och värdceller på hur de kodar för olika proteiner, dess olika tillgång till DNA-byggstenar, samt en uppsjö andra olika egenskaper. Genom att analysera dess DNA eller RNA steg för steg med matematiska algoritmer kan vi kartlägga dess genomiska signatur, som ju är ytterst anpassad och optimerad för att fungera tillsammans med det genetiska maskineri som de själva bär med sig, samt det maskineri i eventuella värdcelles som de infekterat och befinner sig i. Målsättningen för gruppen är att utnyttja dessa genomiska signaturer för att utveckla nya metoder för optimering av virala vektorer, attenuering av virus, samt identifiering och klassificering av nya patogener. Gruppen samarbetar med såväl prekliniska och kliniska avdelningar på Sahlgrenska, som datalogiska grupper på Göteborgs Universitet och Chalmers.
 
Doktoranden kommer bl.a. analysera och kartlägga genomiska signaturer i patogener, såsom virus, bakterier och svamp. Projektet kommer även innefatta utvecklande av algoritmer för analys och modifiering av genomiska signaturer. Utöver ren grundforskning med syfte att öka vår kunskap gällande genomiska signaturer i olika organismer, är en målsättning med projektet att med hjälp av singnaturoptimering kunna optimera gener som klipps in i virala vektorer. Ett annat syfte är att med hjälp av och signatur-deoptimering attenuera virus och på så vis lägga grunden för utvecklandet av nya virala vaccin. Slutligen syftar projektet att med hjälp av kartlagda genomiska signaturer utveckla en plattform för icke-homolog identifiering och klassificering av nya patogener.

Behörighet
För tillträde till utbildning på forskarnivå krävs både grundläggande och särskild behörighet. Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som:
1. avlagt examen på avancerad nivå, eller
2. fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. på annat sätt inom eller utom landet förvärvat motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet till utbildning på forskarnivå har den som med godkänt resultat fullgjort kurs engelska B/6 eller har bedömts ha förvärvat motsvarande kunskaper genom tidigare studier.  

Anställning
Tidsbegränsad anställning 4 år, med omfattning 100%. Placering: Sahlgrenska akademin, institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar. Tillträde enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen
Har du frågor om projektet är du välkommen att kontakta huvudhandledaren Peter Norberg, peter.norberg@gu.se

Ansökan
För fullständig annons samt länk till ansökan se Göteborgs universitets hemsida för lediga anställningar https://www.gu.se/omuniversitetet/aktuellt/lediga-jobb

Ansökan ska vara inkommen senast 2019-01-07  


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.

Varaktighet 6 månader eller längre
Löneform Universitetet tillämpar lokalt avtal om lönesättning av doktorander.

Klicka här för att söka jobbet